תואר שני עם תיזה מחקרית
בוגרי תואר שני כולל עבודת גמר בלבד שסיימו באוניברסיטת בן גוריון או במוסד אקדמי מוכר אחר בישראל. ישנם 2 מסלולים נוספים (משולב וישיר).
בוגרי תואר שני ללא תיזה מחקרית
נדרשים להשלמת תיזה על-מנת להגיש בקשה לקבלה לתואר שלישי. ניתן להירשם למסלול השלמת תיזה באוניברסיטת בן-גוריון בנגב. מסלול זה ניתן לברר במדור רישום. ההרשמה למסלול השלמת תיזה היא במסגרת תואר שני. לאחר סיום פורמלי של השלמת תיזה ניתן להירשם לתואר השלישי או בחלק מהמחלקות (לברר עם ביה"ס קרייטמן) ניתן לעבור למסלול "משולב" כלומר אחרי שנה במסלול "ללא תואר לתיזה" המנחה והמחלקה מבקשים להעביר את הסטודנט לדוקטורט ובמידה והוא מתקבל הוא מגיש מיד את הצעת מחקר הכוללת את התיזה.